168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3131 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3131  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3403  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  92.24 
 
 		 245 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.878713  normal  0.236856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3141  cyclic nucleotide-binding protein  68.95 
 
 		 249 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0400922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  68.95 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  22.44 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6768  cyclic nucleotide-binding protein  24.86 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.65 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.69 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.69 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.73 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  25.91 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.17 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2554  cyclic nucleotide-binding protein  21.85 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531309  normal  0.0738389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  42.37 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  25.79 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4309  cyclic nucleotide-binding  22.58 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.75 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.79 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  24.04 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4311  cyclic nucleotide-binding protein  23.71 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.73 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.43 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1241  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  25.65 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  20.43 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.98 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  30.63 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0213  cyclic nucleotide-binding protein  22.45 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5767  putative HTH Crp family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3712  cyclic nucleotide-binding protein  23.12 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4190  cyclic nucleotide-binding protein  23.12 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  20.31 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  24.84 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  23.08 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1214  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3223  cyclic nucleotide-binding protein  23.59 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319468 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  26.58 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4072  cyclic nucleotide-binding protein  23.59 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4294  cyclic nucleotide-binding protein  23.59 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.803161  normal  0.987027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>