275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3413 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3141  cyclic nucleotide-binding protein  86.35 
 
 		 249 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0400922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3131  cyclic nucleotide-binding protein  68.95 
 
 		 245 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3403  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  69.23 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.878713  normal  0.236856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.34 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  26.63 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  22.89 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.29 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.69 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  22.51 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  23.96 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  23.96 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1015  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000202163  unclonable  0.0000000139192 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  24.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.9 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  25.64 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.94 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  22.68 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  26.01 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.87 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  22.16 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  22.16 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  26 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  22.8 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  26.52 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1482  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.02 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.053801  hitchhiker  0.0000318932 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  22.93 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  25.48 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.06 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  25.39 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  24.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.57 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6981  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  22.16 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  21.65 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>