171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3403 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3403  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 245 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.878713  normal  0.236856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3131  cyclic nucleotide-binding protein  92.24 
 
 		 245 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  69.23 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3141  cyclic nucleotide-binding protein  67.07 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0400922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  26.94 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2554  cyclic nucleotide-binding protein  24.51 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531309  normal  0.0738389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  22.93 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6768  cyclic nucleotide-binding protein  24.86 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.78 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.32 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  28.85 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.78 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.78 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  30.63 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  22.05 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  22.04 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  23.35 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  22.04 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  22.16 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  22.04 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  22.16 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  22.04 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.03 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  20 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  21.62 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.6 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.62 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.63 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  21.51 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.76 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0213  cyclic nucleotide-binding protein  22.45 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  27.51 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  41.56 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  23.76 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  24.12 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.73 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  24.55 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>