More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5563 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  100 
 
 		 527 aa  1045    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  77.71 
 
 		 525 aa  774    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.85 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 518 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 518 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 518 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  33.46 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  33.46 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  33.2 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  34 
 
 		 517 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  33.92 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 518 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 518 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 518 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  34 
 
 		 495 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.56 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  29.42 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.57 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.28 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 529 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 517 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2499  putative multidrug resistance protein  29.72 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.83 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.1 
 
 		 525 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  28.65 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.9 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.85 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.14 
 
 		 515 aa  133  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.05 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.19 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.86 
 
 		 539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.1 
 
 		 520 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.84 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.52 
 
 		 529 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.55 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.52 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.21 
 
 		 530 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.94 
 
 		 529 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.67 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.26 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.22 
 
 		 537 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.35 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.99 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.9 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.52 
 
 		 535 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.35 
 
 		 523 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.35 
 
 		 523 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.11 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.82 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.58 
 
 		 519 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.32 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.02 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.38 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.35 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.02 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.91 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.59 
 
 		 530 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.99 
 
 		 511 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  23.54 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 544 aa  97.8  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.61 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.78 
 
 		 570 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.55 
 
 		 518 aa  97.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.16 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.16 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 528 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  24.06 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.05 
 
 		 509 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 527 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 527 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>