More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2763 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 518 aa  1038    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2499  putative multidrug resistance protein  87.45 
 
 		 518 aa  835    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  95.95 
 
 		 522 aa  940    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  42.91 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  40.44 
 
 		 517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  29.19 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 518 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 518 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 517 aa  143  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.64 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 518 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.22 
 
 		 537 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  27.56 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 539 aa  120  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 		 528 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 518 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  27.37 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.85 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  27.35 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.23 
 
 		 515 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.61 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.69 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.49 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.86 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.78 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.63 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.67 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.24 
 
 		 513 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.71 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.77 
 
 		 522 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.61 
 
 		 514 aa  96.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.55 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.02 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.55 
 
 		 514 aa  95.1  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.57 
 
 		 521 aa  93.6  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.97 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.62 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.62 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.09 
 
 		 537 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.67 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  21.62 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.67 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.67 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.27 
 
 		 515 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  21.62 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.62 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  21.62 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  21.62 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.5 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.29 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.5 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.02 
 
 		 534 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.25 
 
 		 513 aa  87.8  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.85 
 
 		 534 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 519 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  22.05 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.05 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  22.05 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.04 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  22.05 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.05 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.63 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.14 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.15 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.69 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.19 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  21.6 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.95 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  21.6 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  21.6 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.95 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.44 
 
 		 529 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.84 
 
 		 512 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  20.82 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  21.2 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.31 
 
 		 518 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.74 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.89 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.25 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>