More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1742 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  94.98 
 
 		 518 aa  978    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  81.85 
 
 		 518 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  82.39 
 
 		 495 aa  772    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  100 
 
 		 518 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  71.81 
 
 		 518 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  82.05 
 
 		 518 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  81.85 
 
 		 518 aa  810    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  94.79 
 
 		 518 aa  978    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  81.85 
 
 		 518 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  81.85 
 
 		 518 aa  833    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  73.36 
 
 		 518 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  82.24 
 
 		 518 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  91.51 
 
 		 518 aa  924    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  95.17 
 
 		 518 aa  980    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  98.65 
 
 		 518 aa  1026    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  81.85 
 
 		 518 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  95.17 
 
 		 518 aa  980    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  55.32 
 
 		 517 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 527 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  33 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  29.07 
 
 		 517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 501 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 517 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  27.54 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.79 
 
 		 524 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  26 
 
 		 521 aa  147  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.22 
 
 		 515 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  25.21 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.38 
 
 		 526 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.05 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.06 
 
 		 539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 537 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 531 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 530 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.03 
 
 		 521 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  23.89 
 
 		 525 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.56 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.6 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.83 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.48 
 
 		 529 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.82 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 523 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2467  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.9 
 
 		 508 aa  123  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 516 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.61 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.29 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.39 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  23.71 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.18 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.9 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.84 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.95 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 		 517 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 519 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.02 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.02 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.02 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  23.4 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.66 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.69 
 
 		 511 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.43 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.4 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.59 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.85 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.08 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.27 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.25 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.14 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>