More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3622 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  77.71 
 
 		 527 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 525 aa  1046    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.34 
 
 		 518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  33 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 518 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  33 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 518 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 518 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  32.21 
 
 		 518 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  33.67 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  33.27 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  33.27 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  33.27 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  33.27 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  31.21 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 517 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2499  putative multidrug resistance protein  28.88 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.79 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.71 
 
 		 513 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.4 
 
 		 524 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.04 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  28.16 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.29 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.89 
 
 		 529 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.6 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.36 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.27 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.69 
 
 		 539 aa  128  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.47 
 
 		 528 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.75 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.07 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.64 
 
 		 537 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 520 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.58 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.85 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.85 
 
 		 529 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 		 519 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.59 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.85 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.88 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.27 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.96 
 
 		 529 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.27 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.27 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.27 
 
 		 531 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.3 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.17 
 
 		 515 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.56 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.61 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 		 539 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.5 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.5 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 		 511 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.32 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 		 531 aa  98.6  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 512 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.02 
 
 		 514 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.51 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.4 
 
 		 509 aa  96.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.02 
 
 		 516 aa  96.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  23.81 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.51 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.31 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.51 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.58 
 
 		 542 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  23.48 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  20.92 
 
 		 520 aa  94  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.38 
 
 		 542 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>