More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5570 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  100 
 
 		 501 aa  999    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2499  putative multidrug resistance protein  49.4 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 		 522 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  42.06 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  41.43 
 
 		 517 aa  345  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 517 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.71 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  27.59 
 
 		 518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  27.2 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  26.75 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.75 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.23 
 
 		 528 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.31 
 
 		 528 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.48 
 
 		 523 aa  100  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.71 
 
 		 529 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.45 
 
 		 523 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.45 
 
 		 523 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.17 
 
 		 526 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.53 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.55 
 
 		 521 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.65 
 
 		 515 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.22 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.73 
 
 		 525 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  24.28 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.28 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  24.28 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  24.28 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  23.79 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.79 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 528 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.79 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 527 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 527 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.03 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.14 
 
 		 515 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.13 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.9 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.49 
 
 		 515 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.13 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.94 
 
 		 530 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.26 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.09 
 
 		 517 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.69 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.69 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 498 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 537 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.06 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.08 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.84 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.89 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.58 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.48 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.56 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.79 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.48 
 
 		 529 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.44 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.28 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.15 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.81 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.04 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.52 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  23.08 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  23.08 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.33 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>