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for query gene Rmet_4992 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  100 
 
 
504 aa  1004    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  42.06 
 
 
501 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  42.91 
 
 
518 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
522 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2499  putative multidrug resistance protein  42.66 
 
 
518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  37.9 
 
 
517 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
517 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
517 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  27.62 
 
 
518 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  27.31 
 
 
518 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  27.29 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  27.31 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  27.29 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  27.57 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
518 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  27.31 
 
 
517 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.23 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  26.52 
 
 
518 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  28.74 
 
 
527 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  29.28 
 
 
518 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 
525 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  28.69 
 
 
518 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  28.49 
 
 
518 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  28.49 
 
 
518 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  28.29 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  28.29 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  28.29 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  28.29 
 
 
495 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.93 
 
 
537 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.09 
 
 
528 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 
512 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 
493 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 
509 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.16 
 
 
539 aa  97.4  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 
512 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.11 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  22.92 
 
 
521 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.49 
 
 
506 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.02 
 
 
515 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.21 
 
 
513 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.31 
 
 
512 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  24.84 
 
 
534 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 
509 aa  87  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.63 
 
 
515 aa  87  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.04 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.56 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.92 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.47 
 
 
503 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.75 
 
 
515 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.92 
 
 
514 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.47 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.61 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 
520 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.32 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  21.57 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.41 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  21.57 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  21.57 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  21.57 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
527 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.57 
 
 
527 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.98 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.37 
 
 
511 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.3 
 
 
520 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.11 
 
 
522 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.03 
 
 
516 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.77 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.77 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 
513 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.79 
 
 
514 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.16 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.74 
 
 
544 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.67 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.3 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  28.95 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.96 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.19 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.62 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.27 
 
 
517 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  20.94 
 
 
512 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.6 
 
 
507 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.66 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
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CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  20.94 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.94 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  20.94 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  19.05 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
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