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for query gene Bphyt_1822 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 518 aa  1039    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  76.57 
 
 		 495 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  72.39 
 
 		 518 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  75.87 
 
 		 518 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  75.87 
 
 		 518 aa  737    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  72.97 
 
 		 518 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  76.25 
 
 		 518 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  76.25 
 
 		 518 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  72.2 
 
 		 518 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  94.02 
 
 		 518 aa  897    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  71.81 
 
 		 518 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  75.87 
 
 		 518 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  75.68 
 
 		 518 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  72.2 
 
 		 518 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  72.59 
 
 		 518 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  71.62 
 
 		 518 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  75.87 
 
 		 518 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  57.06 
 
 		 517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 527 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  29.98 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  28.2 
 
 		 504 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.18 
 
 		 515 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.95 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.01 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  25.05 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.27 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.43 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 		 521 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.15 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.24 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.94 
 
 		 539 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.62 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.88 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.9 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.15 
 
 		 554 aa  134  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.79 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.77 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.95 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.2 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.49 
 
 		 521 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.21 
 
 		 519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  24.44 
 
 		 525 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  23.96 
 
 		 518 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.37 
 
 		 519 aa  127  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.51 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.73 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.73 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.53 
 
 		 516 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2499  putative multidrug resistance protein  27.04 
 
 		 518 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.23 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.9 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.01 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  23.69 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.22 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.5 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.51 
 
 		 527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.89 
 
 		 532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.58 
 
 		 519 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.69 
 
 		 526 aa  120  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.98 
 
 		 537 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  22.38 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.38 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.16 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2467  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.48 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  22.38 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.35 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.35 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.67 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.01 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.54 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.54 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.43 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.31 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.08 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  25.63 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  25.52 
 
 		 496 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.32 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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