More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1769 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1857  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 518 aa  803    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1367  multidrug resistance protein, putative  82.19 
 
 		 495 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00190261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2378  hypothetical protein  81.66 
 
 		 518 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5132  major facilitator transporter  94.59 
 
 		 518 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.681467  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1128  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 518 aa  803    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2215  multidrug resistance protein, putative  81.47 
 
 		 518 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2365  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  72.97 
 
 		 518 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00539088  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2250  major facilitator transporter  81.85 
 
 		 518 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1822  major facilitator superfamily MFS_1  71.62 
 
 		 518 aa  706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0623497 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0040  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 518 aa  803    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258259  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6248  major facilitator transporter  94.98 
 
 		 518 aa  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1855  major facilitator transporter  94.79 
 
 		 518 aa  975    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1442  major facilitator transporter  91.51 
 
 		 518 aa  926    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816708  normal  0.023125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1769  major facilitator transporter  100 
 
 		 518 aa  1040    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2212  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 518 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1742  major facilitator transporter  98.65 
 
 		 518 aa  1026    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1831  major facilitator transporter  94.98 
 
 		 518 aa  977    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0091449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7495  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5563  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3622  major facilitator superfamily transporter  33 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1473  putative multidrug resistance-like transmembrane protein  29.02 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  0.117108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5570  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 501 aa  173  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1422  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 517 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4992  MFS family membrane efflux protein  27.54 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.350933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.79 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2005  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.22 
 
 		 515 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  25.41 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.64 
 
 		 523 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.64 
 
 		 523 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.38 
 
 		 526 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.05 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2763  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 518 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.64 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.23 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 		 537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 531 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 531 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.69 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.83 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  24.09 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2467  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.1 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.24 
 
 		 515 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.5 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 516 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.56 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.83 
 
 		 539 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.03 
 
 		 515 aa  126  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.05 
 
 		 523 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.63 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2359  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.410031  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.12 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.13 
 
 		 519 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.59 
 
 		 521 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 519 aa  123  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.51 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.72 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.95 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  23.81 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.9 
 
 		 513 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.16 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.66 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.77 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.5 
 
 		 526 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.08 
 
 		 525 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.27 
 
 		 532 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.59 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.45 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.69 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.93 
 
 		 537 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>