More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05493 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05493  transcription regulator protein  100 
 
 		 323 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.564857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5623  LysR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 323 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.919335  normal  0.153906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2438  LysR family transcriptional regulator  71.3 
 
 		 324 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2143  LysR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2223  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5603  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5256  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 345 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6638  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0492  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2342  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2423  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.896405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1996  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5557  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  35.23 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5786  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0887  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  35.17 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7040  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6105  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  33.57 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4851  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204914  normal  0.243062 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5409  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 342 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6515  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1314  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0600  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5066  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2398  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.97 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00680  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1879  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47080  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5810  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6414  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3403  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.641186 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5908  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2527  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4353  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  33.45 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5543  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0526  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6111  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450926  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2913  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5874  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4825  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3341  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>