More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0526 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0526  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02290  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0261  putative transcriptional regulator  39.45 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3875  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656109  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5034  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1464  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3487  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.23 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.83 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30990  Transcriptional regulator LysR family protein  36.99 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1429  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1853  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0383468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1754  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3859  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 312 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3304  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1510  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451093  normal  0.28121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  38.08 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5381  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.5816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0549  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0269293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4096  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2072  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.01 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4436  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4186  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5557  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  33.68 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0634  transcription regulator protein  36.73 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5786  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3620  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1614  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0616  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1711  transcriptional regulator, LysR family  36.19 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.530913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>