More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1879 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1879  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47080  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1168  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5802  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3868  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4501  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1349  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4062  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2389  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1150  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1981  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0250  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1962  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0910  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1590  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.274379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2124  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 773 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0441945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2586  carbonate dehydratase  30.51 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05493  transcription regulator protein  30.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.564857 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  28.62 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  29.63 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.16 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0526  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  27.74 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  32.2 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  31.48 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  33.58 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3875  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656109  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2438  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  29.35 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0476  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4844  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>