More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6515 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6105  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6515  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1314  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7040  LysR family transcriptional regulator  91.97 
 
 		 300 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01928  transcriptional regulator, LysR family protein  48.15 
 
 		 300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.412862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2621  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4579  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1287  transcriptional regulator, LysR family  48.14 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3864  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.650106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0807  transcriptional regulator, LysR family  54.64 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05493  transcription regulator protein  34.01 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.564857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5623  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.919335  normal  0.153906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2223  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2143  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.27 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 335 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  31.23 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  28 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2438  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 415 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 428 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2423  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.896405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 312 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 305 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2938  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.94 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.623506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5786  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4738  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.44438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5557  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 345 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0720  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0735  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  32.78 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4884  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000596604  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  26.37 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>