More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4317 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0692  transcriptional regulator, LysR family  55.82 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37910  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000602426  normal  0.0887271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  40.48 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0231  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1053  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4520  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  0.633071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4062  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0198165  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6541  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal  0.402814 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6056  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18637  normal  0.867565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5692  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03330  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  37.33 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  35.56 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 334 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.48 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1454  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.508797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0455  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>