More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3339 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  58.72 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  53.47 
 
 		 310 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  52.32 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 309 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 303 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  53.14 
 
 		 303 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0209  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  36.64 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.37 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  35.89 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 334 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 344 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5755  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  39.1 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2896  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  37.5 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0577  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  32.52 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>