More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2621 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2621  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01928  transcriptional regulator, LysR family protein  51.86 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.412862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4579  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3864  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.650106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1287  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0807  transcriptional regulator, LysR family  51.7 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7040  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6515  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6105  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1314  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2223  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3446  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  31.65 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  29.14 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0887  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1678  transcriptional regulator, LysR family  33.95 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2283  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95602  normal  0.350255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  28.05 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.38 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 367 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 351 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 367 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>