196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2403 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  80.91 
 
 		 772 aa  1307    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  82.57 
 
 		 769 aa  1295    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  62.75 
 
 		 773 aa  956    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  61.86 
 
 		 779 aa  930    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  63.29 
 
 		 778 aa  1001    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  53.52 
 
 		 737 aa  750    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  54.9 
 
 		 762 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 770 aa  1568    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  81 
 
 		 763 aa  1296    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  54.86 
 
 		 760 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  38.69 
 
 		 795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  38.71 
 
 		 804 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  38.95 
 
 		 795 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  38.45 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  35.97 
 
 		 779 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  35.56 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  33.79 
 
 		 819 aa  429  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.08 
 
 		 793 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  35.29 
 
 		 816 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  38.04 
 
 		 773 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  34.22 
 
 		 814 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  33.92 
 
 		 842 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  34.88 
 
 		 805 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.44 
 
 		 824 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  32.22 
 
 		 855 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  31.64 
 
 		 854 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  31.45 
 
 		 855 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  32.8 
 
 		 860 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  35.73 
 
 		 799 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  31.69 
 
 		 854 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  31.4 
 
 		 854 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  31.53 
 
 		 855 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 855 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  29.69 
 
 		 841 aa  361  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  29.83 
 
 		 852 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  33.69 
 
 		 789 aa  326  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  25.89 
 
 		 725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  24.76 
 
 		 674 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  24.58 
 
 		 708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.1 
 
 		 694 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  26 
 
 		 718 aa  167  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.24 
 
 		 712 aa  167  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.44 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.07 
 
 		 724 aa  138  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.18 
 
 		 809 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  27.12 
 
 		 827 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.05 
 
 		 809 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  23.01 
 
 		 769 aa  93.2  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.68 
 
 		 827 aa  92  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  24.88 
 
 		 792 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.01 
 
 		 818 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  22.38 
 
 		 795 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  22.6 
 
 		 806 aa  87  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  23.04 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.18 
 
 		 810 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.16 
 
 		 795 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  23.29 
 
 		 738 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  25 
 
 		 821 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  23.83 
 
 		 831 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.72 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  30.5 
 
 		 844 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  27.73 
 
 		 821 aa  80.1  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.84 
 
 		 818 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  23.49 
 
 		 790 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  24.15 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  22.17 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  21.34 
 
 		 796 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  21.34 
 
 		 796 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26.06 
 
 		 817 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.52 
 
 		 796 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.18 
 
 		 796 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.34 
 
 		 796 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.18 
 
 		 796 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.37 
 
 		 770 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.71 
 
 		 796 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  38.05 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  24.28 
 
 		 693 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  22.94 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  22.96 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  22.13 
 
 		 804 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  22.98 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  28.4 
 
 		 812 aa  72.4  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.47 
 
 		 796 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  22.36 
 
 		 796 aa  72  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  23.34 
 
 		 803 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  23.42 
 
 		 807 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  22.8 
 
 		 819 aa  70.9  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.36 
 
 		 796 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  32.28 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  23.23 
 
 		 787 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  23.73 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  27.05 
 
 		 774 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  33.08 
 
 		 808 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  22.57 
 
 		 874 aa  70.1  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  21.89 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  23.97 
 
 		 787 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  23.98 
 
 		 768 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  25.38 
 
 		 947 aa  67.8  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  24.93 
 
 		 821 aa  67.4  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  23.48 
 
 		 803 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>