162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2441 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
814 aa  1675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  73.18 
 
 
805 aa  1164    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  64.96 
 
 
816 aa  1026    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  66 
 
 
842 aa  1077    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  36.95 
 
 
804 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.86 
 
 
779 aa  475  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  36.47 
 
 
795 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  36.47 
 
 
779 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.59 
 
 
819 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  36.96 
 
 
795 aa  466  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  35.86 
 
 
795 aa  459  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  35.64 
 
 
778 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  35.32 
 
 
772 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  36.64 
 
 
799 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  34.91 
 
 
763 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  35.2 
 
 
779 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  34.06 
 
 
773 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  35.16 
 
 
737 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  35.03 
 
 
769 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  33.63 
 
 
762 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  34.25 
 
 
770 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  33.21 
 
 
760 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  34.85 
 
 
773 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  31.8 
 
 
824 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 
793 aa  355  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  31.71 
 
 
854 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  31.59 
 
 
854 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  31.73 
 
 
854 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  30.77 
 
 
855 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  30.97 
 
 
855 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.04 
 
 
855 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  30.85 
 
 
855 aa  337  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  33.5 
 
 
789 aa  335  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  30.41 
 
 
860 aa  320  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  31.2 
 
 
852 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  28.8 
 
 
841 aa  314  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  22.18 
 
 
708 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  21.91 
 
 
674 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.37 
 
 
694 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.49 
 
 
701 aa  117  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  23.75 
 
 
725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.46 
 
 
724 aa  105  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.46 
 
 
712 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  24 
 
 
718 aa  92  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.58 
 
 
827 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.88 
 
 
806 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  24.89 
 
 
847 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  24.57 
 
 
821 aa  77.4  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  24.82 
 
 
809 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  25.12 
 
 
769 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23 
 
 
808 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  24.71 
 
 
760 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  24.45 
 
 
813 aa  75.5  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25.41 
 
 
818 aa  75.1  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.35 
 
 
810 aa  74.3  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  24.89 
 
 
790 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  24.15 
 
 
804 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  24.63 
 
 
827 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  24.58 
 
 
809 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  23.72 
 
 
847 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  23.49 
 
 
839 aa  72.4  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  23.67 
 
 
854 aa  72  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  22.36 
 
 
821 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  22.41 
 
 
821 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  24.29 
 
 
829 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  22.36 
 
 
803 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  24.62 
 
 
864 aa  68.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  23.14 
 
 
698 aa  68.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  21.73 
 
 
738 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  23.51 
 
 
817 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.73 
 
 
818 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  24.22 
 
 
813 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  24.22 
 
 
813 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.27 
 
 
823 aa  64.3  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  24.32 
 
 
796 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  24.13 
 
 
796 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  24.13 
 
 
796 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  22.77 
 
 
824 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  23.96 
 
 
813 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.13 
 
 
796 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  24.34 
 
 
779 aa  63.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.78 
 
 
796 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.78 
 
 
796 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.39 
 
 
811 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.83 
 
 
796 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.21 
 
 
796 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.13 
 
 
796 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.78 
 
 
796 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  23.4 
 
 
816 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  22.39 
 
 
837 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1282  peptidase S45 penicillin amidase  25.5 
 
 
775 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224327  normal  0.39054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  23.17 
 
 
855 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  23.74 
 
 
787 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  23.27 
 
 
795 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  24.08 
 
 
786 aa  57  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  21.29 
 
 
693 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  24.32 
 
 
963 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  23.66 
 
 
813 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  29.24 
 
 
906 aa  56.2  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  25.98 
 
 
827 aa  55.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>