192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2901 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  100 
 
 		 772 aa  1565    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  59.08 
 
 		 773 aa  915    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  53.02 
 
 		 737 aa  745    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  58.79 
 
 		 779 aa  885    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  61.32 
 
 		 778 aa  961    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  54.28 
 
 		 762 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  93.11 
 
 		 769 aa  1439    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  80.91 
 
 		 770 aa  1281    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  97.25 
 
 		 763 aa  1510    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  54.55 
 
 		 760 aa  782    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  39.74 
 
 		 795 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  39.11 
 
 		 795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.61 
 
 		 795 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  38.57 
 
 		 804 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.48 
 
 		 819 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  36.03 
 
 		 779 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.38 
 
 		 779 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  37.11 
 
 		 816 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  35.44 
 
 		 814 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  35.04 
 
 		 842 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.72 
 
 		 793 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  37.34 
 
 		 773 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  35 
 
 		 824 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  36.71 
 
 		 805 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  33.37 
 
 		 855 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  32.76 
 
 		 854 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  32.88 
 
 		 854 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  32.75 
 
 		 855 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  32.47 
 
 		 860 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  32.39 
 
 		 854 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.63 
 
 		 855 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 855 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  35.51 
 
 		 799 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  30.28 
 
 		 841 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  30.66 
 
 		 852 aa  334  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  32.28 
 
 		 789 aa  327  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  25.63 
 
 		 725 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  24.39 
 
 		 674 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  23.77 
 
 		 708 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.62 
 
 		 694 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.93 
 
 		 712 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  27.51 
 
 		 718 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.24 
 
 		 701 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.17 
 
 		 724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.85 
 
 		 738 aa  97.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.84 
 
 		 818 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.43 
 
 		 809 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  25.9 
 
 		 812 aa  94.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  23.34 
 
 		 795 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.44 
 
 		 795 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.11 
 
 		 809 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  24.63 
 
 		 827 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  22.38 
 
 		 795 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.79 
 
 		 827 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  23.22 
 
 		 795 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25.41 
 
 		 792 aa  89  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  24.15 
 
 		 803 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  23.1 
 
 		 769 aa  87.4  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.47 
 
 		 821 aa  84.7  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  24.4 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  24.74 
 
 		 760 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  22.38 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  23.5 
 
 		 809 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  22.7 
 
 		 788 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  27.53 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  39.29 
 
 		 785 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.44 
 
 		 821 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  21.99 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.84 
 
 		 818 aa  74.7  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  22.99 
 
 		 787 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.72 
 
 		 806 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.18 
 
 		 813 aa  73.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.27 
 
 		 844 aa  73.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  24.11 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  25.18 
 
 		 817 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  30.06 
 
 		 808 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  26.72 
 
 		 841 aa  70.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  28.51 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.84 
 
 		 811 aa  70.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  24.78 
 
 		 821 aa  70.5  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.22 
 
 		 829 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.21 
 
 		 823 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  24.14 
 
 		 831 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  22.98 
 
 		 819 aa  67  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  23.03 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  32.91 
 
 		 847 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  24.49 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  21.8 
 
 		 833 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  23.83 
 
 		 807 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  25.64 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.46 
 
 		 770 aa  65.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.83 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  21.57 
 
 		 874 aa  65.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  29.5 
 
 		 836 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.11 
 
 		 819 aa  63.9  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  24.18 
 
 		 769 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  23.63 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  24.04 
 
 		 780 aa  62.4  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  23.63 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  23.93 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>