188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  53.92 
 
 
769 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  53.02 
 
 
772 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  52.7 
 
 
773 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  51.54 
 
 
779 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  53.52 
 
 
770 aa  752    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  53 
 
 
778 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  100 
 
 
737 aa  1498    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  57.97 
 
 
762 aa  840    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  52.88 
 
 
763 aa  772    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  57.84 
 
 
760 aa  837    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  40.08 
 
 
795 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  39.95 
 
 
795 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  39.56 
 
 
804 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.84 
 
 
795 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  38.54 
 
 
779 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  37.67 
 
 
779 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.45 
 
 
819 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  36.07 
 
 
793 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  35.16 
 
 
814 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  34.19 
 
 
816 aa  429  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  33.93 
 
 
842 aa  419  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  38.5 
 
 
773 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  35.46 
 
 
805 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  32.83 
 
 
841 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  35.38 
 
 
799 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  31.2 
 
 
854 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  31.07 
 
 
854 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  35.12 
 
 
824 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  31.65 
 
 
855 aa  376  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  31.65 
 
 
854 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  31.14 
 
 
855 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  31.02 
 
 
855 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.02 
 
 
855 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  30.7 
 
 
860 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  30.35 
 
 
852 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  32.15 
 
 
789 aa  320  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  25.27 
 
 
708 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  25.27 
 
 
674 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.49 
 
 
694 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  26.05 
 
 
718 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  25.85 
 
 
725 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.63 
 
 
712 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.86 
 
 
724 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.42 
 
 
701 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.55 
 
 
738 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.81 
 
 
809 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.45 
 
 
818 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.27 
 
 
809 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.65 
 
 
769 aa  90.5  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.74 
 
 
818 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.09 
 
 
787 aa  86.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  26.29 
 
 
792 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  26.52 
 
 
760 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  24.41 
 
 
788 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  24.82 
 
 
833 aa  82.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.71 
 
 
795 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  24.47 
 
 
788 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  22.82 
 
 
819 aa  81.6  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.62 
 
 
810 aa  81.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  24.3 
 
 
795 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.85 
 
 
821 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.67 
 
 
787 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.54 
 
 
770 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  25.94 
 
 
821 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  23.15 
 
 
819 aa  79.7  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.55 
 
 
827 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.5 
 
 
795 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.41 
 
 
813 aa  78.2  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.48 
 
 
787 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  25.21 
 
 
829 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  25.27 
 
 
827 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.12 
 
 
795 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  24.26 
 
 
790 aa  75.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  23.38 
 
 
806 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.13 
 
 
823 aa  75.5  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.43 
 
 
808 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  23.18 
 
 
825 aa  74.7  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  22.51 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  23.92 
 
 
809 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  23.92 
 
 
809 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.36 
 
 
761 aa  71.6  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  30.95 
 
 
847 aa  70.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  24.07 
 
 
779 aa  70.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  25.29 
 
 
803 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.76 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  24.76 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.79 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.76 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.4 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  24.76 
 
 
796 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.76 
 
 
796 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  25.37 
 
 
812 aa  68.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.13 
 
 
809 aa  67.8  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  27.39 
 
 
807 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  24.56 
 
 
839 aa  68.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 
785 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  23.89 
 
 
812 aa  67  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  25.06 
 
 
829 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.76 
 
 
796 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  20.36 
 
 
810 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>