178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2547 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  100 
 
 		 795 aa  1613    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  82.85 
 
 		 795 aa  1328    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  69 
 
 		 804 aa  1087    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  81.75 
 
 		 795 aa  1301    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  38.59 
 
 		 778 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  39.42 
 
 		 737 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  39.26 
 
 		 773 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  39.87 
 
 		 763 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  38.77 
 
 		 779 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  39.61 
 
 		 772 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  40.1 
 
 		 762 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  39.22 
 
 		 779 aa  515  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  39.51 
 
 		 779 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  39.8 
 
 		 760 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  39.92 
 
 		 769 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  38.55 
 
 		 770 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  36.87 
 
 		 819 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  38.06 
 
 		 816 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  35.94 
 
 		 814 aa  459  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  37.56 
 
 		 805 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  37.02 
 
 		 842 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  38.42 
 
 		 773 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  32.96 
 
 		 793 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  36.62 
 
 		 799 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.97 
 
 		 824 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  32.17 
 
 		 841 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  33.7 
 
 		 854 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  33.7 
 
 		 854 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  33.25 
 
 		 855 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  33.5 
 
 		 855 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.37 
 
 		 855 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  32.2 
 
 		 854 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  33.25 
 
 		 855 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  32.6 
 
 		 860 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  33.59 
 
 		 789 aa  334  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  32.17 
 
 		 852 aa  334  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  22.99 
 
 		 708 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  23.13 
 
 		 674 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.97 
 
 		 694 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.42 
 
 		 725 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.67 
 
 		 712 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.81 
 
 		 701 aa  118  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.8 
 
 		 718 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  24.75 
 
 		 770 aa  96.3  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.24 
 
 		 724 aa  94.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.15 
 
 		 813 aa  94.4  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.5 
 
 		 809 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  25.71 
 
 		 829 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.52 
 
 		 810 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  25 
 
 		 821 aa  90.9  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.66 
 
 		 818 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  25.43 
 
 		 809 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  25.22 
 
 		 812 aa  89.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  24.88 
 
 		 792 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  25.35 
 
 		 827 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  23.62 
 
 		 839 aa  81.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  23.4 
 
 		 837 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.35 
 
 		 827 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.28 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  23.1 
 
 		 824 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  25.62 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  24.39 
 
 		 837 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.93 
 
 		 779 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  23.68 
 
 		 837 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.42 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  23.61 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  23.25 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  23.61 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  24.39 
 
 		 837 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  23.61 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  23.61 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  23.87 
 
 		 768 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  24.83 
 
 		 783 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  22.72 
 
 		 811 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  25.84 
 
 		 760 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  22.84 
 
 		 824 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  22.94 
 
 		 847 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  24.05 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  22.29 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  26.48 
 
 		 821 aa  70.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  25.98 
 
 		 817 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  21.98 
 
 		 816 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  25.2 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  26.21 
 
 		 819 aa  68.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  23.55 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  20.67 
 
 		 823 aa  68.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  24.93 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  24.86 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  26.98 
 
 		 885 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  23.34 
 
 		 807 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  23.19 
 
 		 787 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  21.29 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  22.06 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  23.62 
 
 		 858 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  23.74 
 
 		 836 aa  64.3  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  26.91 
 
 		 792 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  23.33 
 
 		 795 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  21.31 
 
 		 780 aa  63.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  24.08 
 
 		 795 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  26.4 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>