169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3883 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  67.14 
 
 		 805 aa  1098    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 842 aa  1726    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  66 
 
 		 814 aa  1078    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  62.63 
 
 		 816 aa  1000    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  36.28 
 
 		 795 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  36.86 
 
 		 795 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  36.44 
 
 		 804 aa  459  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  35.27 
 
 		 779 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  37.02 
 
 		 795 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  35.62 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  35.21 
 
 		 778 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.07 
 
 		 779 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  35.43 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  35.05 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  33.84 
 
 		 819 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  35.79 
 
 		 763 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  35.42 
 
 		 769 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  34.06 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  33.87 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  33.58 
 
 		 760 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  34.42 
 
 		 770 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  33.58 
 
 		 799 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  35.46 
 
 		 773 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  31.37 
 
 		 824 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  32.33 
 
 		 793 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  34.38 
 
 		 789 aa  337  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  30.22 
 
 		 854 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  29.98 
 
 		 854 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  30.49 
 
 		 860 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  30.1 
 
 		 854 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  30.99 
 
 		 855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 855 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  30.63 
 
 		 855 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  30.87 
 
 		 855 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  30.25 
 
 		 841 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  30.76 
 
 		 852 aa  302  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.92 
 
 		 701 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  21.73 
 
 		 708 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.35 
 
 		 809 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  22.1 
 
 		 674 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.07 
 
 		 809 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.12 
 
 		 813 aa  94.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.32 
 
 		 712 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.42 
 
 		 821 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.28 
 
 		 829 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  24.3 
 
 		 718 aa  89.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  25.23 
 
 		 804 aa  89  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  25.53 
 
 		 790 aa  85.5  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  21.12 
 
 		 694 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.3 
 
 		 724 aa  85.1  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25.3 
 
 		 818 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  25.96 
 
 		 821 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  23.93 
 
 		 803 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  21.55 
 
 		 725 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  25.66 
 
 		 760 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.32 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  24.61 
 
 		 854 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  24.22 
 
 		 864 aa  74.3  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  23.68 
 
 		 824 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23.75 
 
 		 808 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  24.03 
 
 		 807 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  23.93 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  23.89 
 
 		 847 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  24.6 
 
 		 812 aa  72.8  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.11 
 
 		 810 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.14 
 
 		 796 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.27 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  23.93 
 
 		 816 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.21 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  25.39 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  21.53 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  25.47 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  25.47 
 
 		 813 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  24.51 
 
 		 827 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.1 
 
 		 796 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  24.07 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  23.53 
 
 		 817 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  24.15 
 
 		 839 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.1 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  22.1 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.69 
 
 		 827 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.88 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  24.3 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  22.95 
 
 		 847 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.88 
 
 		 796 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.61 
 
 		 779 aa  67  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.88 
 
 		 796 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  24.59 
 
 		 797 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.87 
 
 		 796 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.03 
 
 		 806 aa  67.4  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  22.94 
 
 		 796 aa  66.6  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.39 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.25 
 
 		 796 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  24.15 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  22.76 
 
 		 831 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  24.41 
 
 		 813 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.17 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.41 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  23.46 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>