193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  54.28 
 
 
772 aa  804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  57.97 
 
 
737 aa  837    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  54.04 
 
 
773 aa  825    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  54.15 
 
 
769 aa  773    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  54.95 
 
 
779 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  56.05 
 
 
778 aa  862    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  54.9 
 
 
770 aa  791    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  100 
 
 
762 aa  1551    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  54.2 
 
 
763 aa  804    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  94.08 
 
 
760 aa  1432    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  39.45 
 
 
795 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  39.05 
 
 
795 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.95 
 
 
795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  39.27 
 
 
804 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  36.41 
 
 
819 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  38.46 
 
 
779 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  37.48 
 
 
779 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  38.27 
 
 
799 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  36.03 
 
 
816 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.68 
 
 
793 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  33.5 
 
 
842 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  32.53 
 
 
841 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  33.38 
 
 
814 aa  399  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  38.38 
 
 
773 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  35.4 
 
 
824 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  32.64 
 
 
854 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  32.56 
 
 
855 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  34.06 
 
 
805 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  32.15 
 
 
854 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  32.97 
 
 
855 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.41 
 
 
855 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 
855 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  31.17 
 
 
854 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  30.6 
 
 
860 aa  365  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  31.55 
 
 
852 aa  353  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  32.81 
 
 
789 aa  326  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  26.47 
 
 
674 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  26.47 
 
 
708 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.88 
 
 
694 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  25.35 
 
 
725 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  27.46 
 
 
718 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.52 
 
 
712 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.37 
 
 
724 aa  153  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.38 
 
 
701 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.51 
 
 
738 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.95 
 
 
821 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  24.17 
 
 
808 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.44 
 
 
809 aa  94  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  25.95 
 
 
827 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.61 
 
 
787 aa  92  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.22 
 
 
811 aa  91.3  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.46 
 
 
809 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  27.88 
 
 
827 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.35 
 
 
818 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  23.93 
 
 
769 aa  87.4  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  30.03 
 
 
818 aa  85.9  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.83 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.18 
 
 
813 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.3 
 
 
810 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.62 
 
 
864 aa  82.4  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  23.5 
 
 
760 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  25.77 
 
 
837 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.58 
 
 
821 aa  80.9  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  25.77 
 
 
837 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  25.77 
 
 
837 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  25.6 
 
 
823 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  25.6 
 
 
837 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  25.6 
 
 
837 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  25.6 
 
 
837 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.06 
 
 
806 aa  78.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  27.98 
 
 
812 aa  75.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  23.68 
 
 
819 aa  75.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  21.99 
 
 
795 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.41 
 
 
844 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  23.98 
 
 
857 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  23.84 
 
 
825 aa  71.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.95 
 
 
792 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  24.94 
 
 
768 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  23.99 
 
 
843 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  24.07 
 
 
782 aa  70.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  26.27 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.26 
 
 
807 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  24.49 
 
 
839 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  24.19 
 
 
809 aa  70.1  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  23.01 
 
 
779 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  25.65 
 
 
813 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.53 
 
 
836 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  26.32 
 
 
821 aa  68.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.68 
 
 
823 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  23.4 
 
 
829 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  25.42 
 
 
813 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  27.67 
 
 
947 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  32.59 
 
 
841 aa  67.8  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  26.2 
 
 
742 aa  67.4  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  22.74 
 
 
795 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  26.27 
 
 
641 aa  67  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  37.5 
 
 
785 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.35 
 
 
761 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  24.94 
 
 
813 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  22.31 
 
 
803 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>