196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2563 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  61.32 
 
 		 772 aa  961    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  63.29 
 
 		 770 aa  982    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  69.08 
 
 		 773 aa  1108    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  67.65 
 
 		 779 aa  1061    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 778 aa  1603    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  53 
 
 		 737 aa  768    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  56.05 
 
 		 762 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  62.01 
 
 		 769 aa  955    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  61.24 
 
 		 763 aa  954    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  55.92 
 
 		 760 aa  837    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  39.58 
 
 		 804 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  38.35 
 
 		 795 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  38.88 
 
 		 795 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  38.59 
 
 		 795 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  36.34 
 
 		 819 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  36.84 
 
 		 779 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.95 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  35.21 
 
 		 842 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  35.29 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  35.33 
 
 		 816 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  37.22 
 
 		 805 aa  425  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  37.14 
 
 		 773 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.84 
 
 		 824 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  32.89 
 
 		 855 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  32.68 
 
 		 855 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.48 
 
 		 855 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 855 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  35.53 
 
 		 799 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  31.62 
 
 		 854 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  32.28 
 
 		 793 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  31.55 
 
 		 854 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  31.55 
 
 		 854 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  31.48 
 
 		 860 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  29.46 
 
 		 841 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  31.46 
 
 		 852 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  33.12 
 
 		 789 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.47 
 
 		 694 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  25.03 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  25.28 
 
 		 674 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  25.38 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.99 
 
 		 718 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.26 
 
 		 701 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.04 
 
 		 724 aa  151  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.88 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.59 
 
 		 809 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.79 
 
 		 818 aa  96.3  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.47 
 
 		 809 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.26 
 
 		 738 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  23.26 
 
 		 806 aa  94  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  26.09 
 
 		 821 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.75 
 
 		 813 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  26.63 
 
 		 827 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  23.36 
 
 		 769 aa  91.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  25.17 
 
 		 825 aa  90.9  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  27.73 
 
 		 827 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.71 
 
 		 795 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.04 
 
 		 821 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26.21 
 
 		 817 aa  85.5  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  24.87 
 
 		 770 aa  84.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  23.46 
 
 		 795 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  22.97 
 
 		 760 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  23.49 
 
 		 804 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  23.34 
 
 		 821 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  22.41 
 
 		 811 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.85 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  21.29 
 
 		 819 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.85 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  21.48 
 
 		 796 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  24.36 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  23.16 
 
 		 803 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.34 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.29 
 
 		 823 aa  78.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  23.55 
 
 		 779 aa  77.8  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.31 
 
 		 808 aa  77.4  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.55 
 
 		 796 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.21 
 
 		 796 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.2 
 
 		 796 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.21 
 
 		 796 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.45 
 
 		 796 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.16 
 
 		 819 aa  76.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  33.83 
 
 		 818 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  24.59 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  24.94 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.81 
 
 		 796 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  24.63 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  21.33 
 
 		 833 aa  74.7  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  24.53 
 
 		 788 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  25.11 
 
 		 768 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  24.57 
 
 		 829 aa  74.3  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  23.81 
 
 		 790 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  28.44 
 
 		 641 aa  73.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  23.66 
 
 		 768 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  24.71 
 
 		 792 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  21.31 
 
 		 796 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  21.98 
 
 		 824 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  32.48 
 
 		 785 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  22.41 
 
 		 847 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.79 
 
 		 807 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  23.21 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  24.52 
 
 		 803 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>