180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1971 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  51.94 
 
 		 737 aa  763    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  58.79 
 
 		 772 aa  913    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  89.52 
 
 		 773 aa  1439    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 779 aa  1594    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  68.04 
 
 		 778 aa  1094    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  62.42 
 
 		 770 aa  936    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  54.95 
 
 		 762 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  59.95 
 
 		 769 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  58.85 
 
 		 763 aa  905    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  54.94 
 
 		 760 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  37.7 
 
 		 795 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.11 
 
 		 795 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  37.47 
 
 		 795 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  38.34 
 
 		 804 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  36.41 
 
 		 842 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  37.15 
 
 		 779 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.8 
 
 		 779 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  35.41 
 
 		 816 aa  436  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.38 
 
 		 819 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.67 
 
 		 793 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  34.82 
 
 		 814 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  36.26 
 
 		 773 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  35.49 
 
 		 824 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  35.78 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  32.73 
 
 		 855 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  32.8 
 
 		 855 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.8 
 
 		 855 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  33.37 
 
 		 860 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 		 855 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  35.1 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  31.68 
 
 		 854 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  29.72 
 
 		 841 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  31.26 
 
 		 854 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  32.48 
 
 		 854 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  32.84 
 
 		 852 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  33.55 
 
 		 789 aa  328  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  24.71 
 
 		 708 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 674 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.48 
 
 		 694 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.97 
 
 		 725 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  24.04 
 
 		 718 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.88 
 
 		 712 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.44 
 
 		 724 aa  130  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.54 
 
 		 701 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.21 
 
 		 738 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.28 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.37 
 
 		 818 aa  82.4  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.96 
 
 		 823 aa  82  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  23.88 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  24.64 
 
 		 827 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  25.48 
 
 		 818 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  21.92 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  21.36 
 
 		 833 aa  77.4  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.77 
 
 		 821 aa  77.4  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  21.8 
 
 		 808 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  27.67 
 
 		 827 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  23.04 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  22.49 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.37 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  21.8 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.53 
 
 		 813 aa  74.3  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  23.64 
 
 		 821 aa  73.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  23.93 
 
 		 809 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  22.99 
 
 		 788 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  23.25 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  21.9 
 
 		 812 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  27.57 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.15 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.35 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  22.69 
 
 		 817 aa  70.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  23.4 
 
 		 809 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  22.27 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  20.19 
 
 		 824 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  22.94 
 
 		 787 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  21.97 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  22.07 
 
 		 804 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  20.61 
 
 		 824 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  23.63 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  22.38 
 
 		 847 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  23.79 
 
 		 779 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.53 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  21.35 
 
 		 803 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  23.59 
 
 		 947 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.29 
 
 		 809 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  21.88 
 
 		 769 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  24.12 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  23.57 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  24.09 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  22.59 
 
 		 760 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.69 
 
 		 796 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.13 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  24.55 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  23.86 
 
 		 947 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  23.92 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  23.92 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  23.59 
 
 		 947 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  36.76 
 
 		 785 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  21.96 
 
 		 796 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.96 
 
 		 796 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  25.29 
 
 		 821 aa  63.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>