195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2876 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  54.33 
 
 
772 aa  803    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  53.77 
 
 
773 aa  812    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  54.94 
 
 
779 aa  794    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  55.92 
 
 
778 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  94.08 
 
 
762 aa  1433    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  54.86 
 
 
770 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  57.84 
 
 
737 aa  833    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  54.41 
 
 
769 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  54.33 
 
 
763 aa  803    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  100 
 
 
760 aa  1548    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  39.21 
 
 
795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  38.82 
 
 
795 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.77 
 
 
795 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  38.39 
 
 
804 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  37.16 
 
 
779 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  38.08 
 
 
779 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  36 
 
 
819 aa  458  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  38.2 
 
 
799 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  35.95 
 
 
816 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  32.99 
 
 
793 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 
842 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  37.62 
 
 
773 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  32.91 
 
 
814 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  32.72 
 
 
854 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  31.57 
 
 
841 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  33.17 
 
 
855 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  35.19 
 
 
824 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  33.33 
 
 
855 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  34.11 
 
 
805 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  31.82 
 
 
854 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.76 
 
 
855 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 
855 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  31.33 
 
 
854 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  30.5 
 
 
860 aa  362  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  31.31 
 
 
852 aa  353  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  32.42 
 
 
789 aa  323  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  26.65 
 
 
674 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  26.61 
 
 
708 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  25.85 
 
 
725 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.77 
 
 
694 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  27.6 
 
 
718 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.83 
 
 
712 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.67 
 
 
724 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.89 
 
 
701 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.23 
 
 
821 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.24 
 
 
738 aa  98.2  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  25.4 
 
 
769 aa  96.3  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.67 
 
 
809 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.73 
 
 
787 aa  90.9  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.91 
 
 
818 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  26.49 
 
 
827 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.29 
 
 
809 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23.48 
 
 
808 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.92 
 
 
827 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  22.65 
 
 
811 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  22.88 
 
 
760 aa  84.7  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  27.67 
 
 
770 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.35 
 
 
813 aa  83.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.75 
 
 
818 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.78 
 
 
810 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.57 
 
 
864 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.25 
 
 
806 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.58 
 
 
821 aa  78.2  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  22.83 
 
 
795 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  23.98 
 
 
812 aa  74.3  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  26.09 
 
 
839 aa  73.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.08 
 
 
837 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  25.91 
 
 
837 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  23.14 
 
 
825 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  25.91 
 
 
837 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  24.39 
 
 
807 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  25.73 
 
 
823 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  25.73 
 
 
837 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  25.73 
 
 
837 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  25.73 
 
 
837 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  23.86 
 
 
779 aa  71.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  25.23 
 
 
821 aa  70.5  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  24.71 
 
 
768 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  27.12 
 
 
641 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.07 
 
 
792 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.84 
 
 
761 aa  69.7  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.31 
 
 
844 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  23.57 
 
 
809 aa  68.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  25.99 
 
 
947 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  23.15 
 
 
787 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  21.99 
 
 
795 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.66 
 
 
819 aa  67.8  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  32.59 
 
 
841 aa  67.4  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.76 
 
 
823 aa  67  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  31.94 
 
 
836 aa  67  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  37.5 
 
 
785 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  27.27 
 
 
947 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  25.16 
 
 
788 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  22.2 
 
 
833 aa  66.6  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  24.94 
 
 
857 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  22.54 
 
 
788 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  25.36 
 
 
813 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  25.12 
 
 
813 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  25 
 
 
813 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.11 
 
 
795 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>