203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2388 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  100 
 
 
718 aa  1438    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  47.51 
 
 
724 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  42.72 
 
 
701 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  42.84 
 
 
712 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  27.83 
 
 
694 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  26.04 
 
 
674 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  25.9 
 
 
708 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  26.3 
 
 
725 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  28.53 
 
 
760 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  25.86 
 
 
778 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  24.29 
 
 
738 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27.59 
 
 
821 aa  177  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  27.46 
 
 
762 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  27.6 
 
 
760 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  25.58 
 
 
737 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 
770 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  23.87 
 
 
779 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  24.2 
 
 
773 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  23.51 
 
 
793 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  28.48 
 
 
827 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.88 
 
 
787 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  28.48 
 
 
769 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  25.84 
 
 
763 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.45 
 
 
827 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  29.28 
 
 
788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  27.71 
 
 
772 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  29.5 
 
 
788 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  27.93 
 
 
843 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  26.22 
 
 
804 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.72 
 
 
795 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  27.26 
 
 
769 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.51 
 
 
795 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.85 
 
 
787 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  25.41 
 
 
854 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  28.85 
 
 
787 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.91 
 
 
823 aa  137  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.56 
 
 
809 aa  137  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.01 
 
 
809 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.01 
 
 
809 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  29.18 
 
 
792 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  25.68 
 
 
855 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  26.4 
 
 
779 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  28.08 
 
 
825 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  25.52 
 
 
855 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.7 
 
 
855 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  25.33 
 
 
854 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  25.54 
 
 
855 aa  134  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  25.99 
 
 
822 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.4 
 
 
783 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  25.31 
 
 
808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  25.16 
 
 
854 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  29.27 
 
 
857 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  27.29 
 
 
817 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.2 
 
 
796 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  24.3 
 
 
818 aa  130  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.12 
 
 
855 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  28.21 
 
 
829 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  25.03 
 
 
795 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25 
 
 
796 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.85 
 
 
795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  25 
 
 
854 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  24.19 
 
 
796 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  27.97 
 
 
795 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  25.93 
 
 
807 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  27.65 
 
 
809 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.4 
 
 
796 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.78 
 
 
796 aa  127  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.78 
 
 
796 aa  127  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  23.78 
 
 
796 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  24.9 
 
 
841 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.35 
 
 
809 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  25.49 
 
 
806 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.58 
 
 
796 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  30.06 
 
 
858 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  23.58 
 
 
796 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.58 
 
 
796 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  24.25 
 
 
795 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  23.21 
 
 
860 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  27.03 
 
 
774 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  27.1 
 
 
824 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.3 
 
 
821 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.9 
 
 
803 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.2 
 
 
818 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  25.98 
 
 
762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.65 
 
 
823 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.46 
 
 
810 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.66 
 
 
821 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.09 
 
 
803 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  25.03 
 
 
804 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.46 
 
 
823 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  24.7 
 
 
779 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  24.28 
 
 
852 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  25.69 
 
 
779 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  25.31 
 
 
844 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.11 
 
 
903 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.8 
 
 
770 aa  111  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  24.33 
 
 
799 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.9 
 
 
906 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  22.83 
 
 
811 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  25.47 
 
 
795 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>