182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2161 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  59.08 
 
 		 772 aa  915    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  62.75 
 
 		 770 aa  935    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  100 
 
 		 773 aa  1589    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  60.26 
 
 		 769 aa  905    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  89.52 
 
 		 779 aa  1390    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  52.28 
 
 		 737 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  69.08 
 
 		 778 aa  1108    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  54.04 
 
 		 762 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  58.64 
 
 		 763 aa  909    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  53.77 
 
 		 760 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.26 
 
 		 795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  38.09 
 
 		 795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  38.14 
 
 		 804 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  38.12 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  36.93 
 
 		 779 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.49 
 
 		 779 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  35.67 
 
 		 842 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.17 
 
 		 819 aa  432  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  35.53 
 
 		 816 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  36.57 
 
 		 773 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  33.8 
 
 		 814 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 793 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.89 
 
 		 824 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  34.88 
 
 		 805 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  34.28 
 
 		 854 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  33.54 
 
 		 855 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  33.79 
 
 		 860 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  34.16 
 
 		 854 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  33.46 
 
 		 855 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  33.33 
 
 		 855 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 855 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  33.09 
 
 		 854 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  29.6 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  35.31 
 
 		 799 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  32.08 
 
 		 852 aa  347  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  33.03 
 
 		 789 aa  321  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  24.87 
 
 		 708 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  25.14 
 
 		 674 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.11 
 
 		 694 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.86 
 
 		 725 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  23.91 
 
 		 718 aa  157  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.93 
 
 		 712 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.02 
 
 		 724 aa  124  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.04 
 
 		 701 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.28 
 
 		 738 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.68 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.51 
 
 		 823 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.35 
 
 		 818 aa  82  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  24.11 
 
 		 769 aa  81.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  24.18 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.24 
 
 		 770 aa  80.1  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  22.12 
 
 		 795 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  21.05 
 
 		 795 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.31 
 
 		 821 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  24.6 
 
 		 825 aa  75.1  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.94 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.75 
 
 		 810 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  25.07 
 
 		 818 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  23.32 
 
 		 812 aa  72.4  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  24.31 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.05 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.15 
 
 		 827 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  22.31 
 
 		 833 aa  70.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  24.03 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  23.32 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.04 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  23.52 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  26.17 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  23.08 
 
 		 827 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  22.2 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.12 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.12 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  23.56 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  23.28 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  22.45 
 
 		 769 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  23.36 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  24.31 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  24.93 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  25.63 
 
 		 817 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  22.82 
 
 		 760 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  22.41 
 
 		 770 aa  65.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  23.85 
 
 		 768 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  22.89 
 
 		 874 aa  65.1  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  24.07 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  23.65 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  19.98 
 
 		 824 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  23.95 
 
 		 947 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  28.17 
 
 		 847 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  20.2 
 
 		 824 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  23.38 
 
 		 947 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  23.48 
 
 		 829 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.38 
 
 		 819 aa  62.4  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  23.12 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  42.39 
 
 		 785 aa  62  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  22.82 
 
 		 812 aa  62  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.68 
 
 		 811 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.24 
 
 		 796 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  22.58 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.88 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  22.7 
 
 		 831 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>