204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0937 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  100 
 
 		 724 aa  1475    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  55.71 
 
 		 701 aa  820    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  45.84 
 
 		 712 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  47.51 
 
 		 718 aa  600  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  31.01 
 
 		 694 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  29.68 
 
 		 708 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  29.52 
 
 		 674 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  28.67 
 
 		 725 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  28.02 
 
 		 738 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  26.42 
 
 		 760 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  24.55 
 
 		 760 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  29.5 
 
 		 788 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  24.4 
 
 		 762 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  28.67 
 
 		 788 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  28.91 
 
 		 787 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.61 
 
 		 827 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  24.04 
 
 		 778 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  29.28 
 
 		 787 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.18 
 
 		 809 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.6 
 
 		 795 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  24.69 
 
 		 737 aa  147  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.24 
 
 		 821 aa  147  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.36 
 
 		 796 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  28.12 
 
 		 795 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  27.09 
 
 		 829 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.18 
 
 		 796 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.18 
 
 		 796 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.18 
 
 		 796 aa  144  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  25.18 
 
 		 796 aa  144  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  24.39 
 
 		 827 aa  144  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  25.54 
 
 		 807 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.33 
 
 		 795 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.18 
 
 		 796 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  28.09 
 
 		 795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.36 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.26 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  25 
 
 		 796 aa  142  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  24.82 
 
 		 796 aa  142  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  28.36 
 
 		 769 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  26.8 
 
 		 803 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  26.27 
 
 		 812 aa  138  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  25.59 
 
 		 779 aa  138  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  25.22 
 
 		 787 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  24.37 
 
 		 772 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  24.43 
 
 		 804 aa  137  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  23.16 
 
 		 793 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  24.18 
 
 		 763 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  28.33 
 
 		 770 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  26.98 
 
 		 792 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.15 
 
 		 806 aa  133  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  24.46 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  23.28 
 
 		 779 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.33 
 
 		 823 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.91 
 
 		 795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.36 
 
 		 821 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  24.59 
 
 		 783 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  24.9 
 
 		 779 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  27.1 
 
 		 790 aa  125  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  23.02 
 
 		 773 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  22.17 
 
 		 854 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  28.19 
 
 		 770 aa  122  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  26.49 
 
 		 693 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  24.88 
 
 		 774 aa  120  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  27.74 
 
 		 827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  22.85 
 
 		 804 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  23.23 
 
 		 817 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  24.9 
 
 		 808 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  29.44 
 
 		 825 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  23.46 
 
 		 809 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  22.7 
 
 		 855 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.19 
 
 		 769 aa  117  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.7 
 
 		 855 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  22.7 
 
 		 855 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  22.52 
 
 		 854 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.12 
 
 		 811 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  25.1 
 
 		 824 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  22.88 
 
 		 854 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  22.03 
 
 		 855 aa  114  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.82 
 
 		 857 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  24.78 
 
 		 803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  22.53 
 
 		 795 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  23.71 
 
 		 847 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  25.77 
 
 		 826 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  23.43 
 
 		 819 aa  111  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  23.21 
 
 		 847 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  30.15 
 
 		 818 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  27.32 
 
 		 809 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  31.07 
 
 		 854 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.75 
 
 		 818 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  27.23 
 
 		 789 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  22.15 
 
 		 795 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.89 
 
 		 855 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  25.75 
 
 		 786 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  26.09 
 
 		 724 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  22.68 
 
 		 761 aa  104  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  27.27 
 
 		 698 aa  103  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  22.56 
 
 		 814 aa  103  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  23.96 
 
 		 809 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  23.96 
 
 		 809 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  21.13 
 
 		 860 aa  103  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>