178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3685 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 824 aa  1626    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  34.56 
 
 		 793 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  34.51 
 
 		 795 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  35.52 
 
 		 795 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  34.58 
 
 		 804 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  34.89 
 
 		 773 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  35.49 
 
 		 779 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  34.84 
 
 		 778 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  33.17 
 
 		 860 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  34.97 
 
 		 795 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  32.84 
 
 		 855 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  35 
 
 		 772 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  35.4 
 
 		 762 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  35.26 
 
 		 763 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  35.23 
 
 		 779 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  32.3 
 
 		 854 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  35.44 
 
 		 779 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  32.34 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  32.26 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  32.71 
 
 		 855 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 		 855 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  35.76 
 
 		 769 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.34 
 
 		 855 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  35.19 
 
 		 760 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  32.08 
 
 		 841 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  35.4 
 
 		 773 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  35.12 
 
 		 737 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  34.44 
 
 		 770 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  32.72 
 
 		 852 aa  373  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  31.62 
 
 		 842 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  31.75 
 
 		 814 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  31.91 
 
 		 816 aa  356  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  31.82 
 
 		 805 aa  330  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  32.5 
 
 		 799 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  28.06 
 
 		 819 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  31.5 
 
 		 789 aa  262  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  25.43 
 
 		 674 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  25.83 
 
 		 708 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.09 
 
 		 694 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.62 
 
 		 725 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.57 
 
 		 712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  27.45 
 
 		 718 aa  126  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.23 
 
 		 724 aa  120  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.31 
 
 		 701 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23.18 
 
 		 808 aa  104  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.21 
 
 		 779 aa  97.8  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.01 
 
 		 769 aa  97.4  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  25.64 
 
 		 804 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  24.74 
 
 		 889 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  25.95 
 
 		 789 aa  94.7  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  20.17 
 
 		 811 aa  94  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  22.53 
 
 		 738 aa  91.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26.34 
 
 		 817 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  25.97 
 
 		 787 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.69 
 
 		 821 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  23.86 
 
 		 783 aa  87.4  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.67 
 
 		 829 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  23.04 
 
 		 819 aa  87.4  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25.63 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  27.01 
 
 		 803 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.05 
 
 		 818 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  26.39 
 
 		 813 aa  84.7  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  26.2 
 
 		 760 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.27 
 
 		 819 aa  84  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.43 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.21 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  24.14 
 
 		 761 aa  80.9  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  26.04 
 
 		 724 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  27.48 
 
 		 774 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.34 
 
 		 821 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.32 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  27.45 
 
 		 810 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  24.77 
 
 		 836 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25.96 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  23.73 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.75 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.52 
 
 		 796 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  23.63 
 
 		 796 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.35 
 
 		 827 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.78 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  26.4 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  23.28 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.27 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.27 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.36 
 
 		 827 aa  74.3  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.47 
 
 		 796 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.25 
 
 		 796 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.25 
 
 		 796 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.25 
 
 		 796 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.25 
 
 		 796 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  23.8 
 
 		 847 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  22.35 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  23.54 
 
 		 796 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.14 
 
 		 809 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  25.32 
 
 		 809 aa  71.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  23.72 
 
 		 847 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  26.82 
 
 		 856 aa  70.5  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  20.21 
 
 		 810 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  23.24 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  26.54 
 
 		 784 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>