192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4860 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  69.08 
 
 		 795 aa  1092    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  100 
 
 		 804 aa  1642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  70.92 
 
 		 795 aa  1139    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  70.08 
 
 		 795 aa  1112    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  41.47 
 
 		 779 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  41.1 
 
 		 779 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  39.58 
 
 		 778 aa  552  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  39.56 
 
 		 737 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  39.22 
 
 		 762 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  38.14 
 
 		 773 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  38.83 
 
 		 763 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  38.57 
 
 		 772 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  38.39 
 
 		 760 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  37.9 
 
 		 779 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  38.36 
 
 		 770 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  38.57 
 
 		 769 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  38.25 
 
 		 819 aa  504  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  37.07 
 
 		 814 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  37.72 
 
 		 816 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  38.73 
 
 		 805 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  38.15 
 
 		 773 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  36.74 
 
 		 842 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  34.59 
 
 		 793 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  36.58 
 
 		 799 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.58 
 
 		 824 aa  416  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  32.65 
 
 		 854 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  32.65 
 
 		 854 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  33.01 
 
 		 855 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  32.85 
 
 		 855 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 855 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  31.95 
 
 		 854 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  32.73 
 
 		 855 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  31.53 
 
 		 841 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  31.73 
 
 		 860 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  31.34 
 
 		 852 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  31.99 
 
 		 789 aa  310  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  24.8 
 
 		 674 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  24.67 
 
 		 708 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.68 
 
 		 694 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.9 
 
 		 725 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.85 
 
 		 724 aa  125  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.96 
 
 		 701 aa  123  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25 
 
 		 718 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.83 
 
 		 712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  26.89 
 
 		 760 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.16 
 
 		 813 aa  94.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.62 
 
 		 809 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.46 
 
 		 808 aa  91.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.71 
 
 		 810 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.71 
 
 		 818 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  23.02 
 
 		 837 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  22.9 
 
 		 823 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  22.9 
 
 		 837 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  22.9 
 
 		 837 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.86 
 
 		 779 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  22.9 
 
 		 837 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  22.9 
 
 		 837 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  25.29 
 
 		 809 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.39 
 
 		 827 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  25.58 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  22.9 
 
 		 837 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.53 
 
 		 821 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25.45 
 
 		 818 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  23.26 
 
 		 812 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.72 
 
 		 811 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  25.99 
 
 		 770 aa  82.4  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  25.07 
 
 		 829 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  24.48 
 
 		 769 aa  81.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  24.82 
 
 		 803 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  23.3 
 
 		 821 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  23.75 
 
 		 839 aa  79.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  22.42 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  23.31 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.3 
 
 		 796 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  21.56 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.16 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.49 
 
 		 796 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  24.69 
 
 		 768 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.34 
 
 		 823 aa  75.1  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.77 
 
 		 796 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.77 
 
 		 796 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.74 
 
 		 796 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  22.27 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  20.07 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  24.66 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.86 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.49 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.06 
 
 		 796 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  24.12 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  24.15 
 
 		 816 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  25.14 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  20.81 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  24.91 
 
 		 833 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  25.78 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  23.64 
 
 		 824 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  25.91 
 
 		 963 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  25.78 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  22.41 
 
 		 827 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  23.34 
 
 		 807 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 		 847 aa  71.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>