119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2709 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  82.42 
 
 		 252 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  56.47 
 
 		 256 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  54.9 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  56.08 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  52.92 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  52.16 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  55.29 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  54.51 
 
 		 249 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  54.12 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  50.98 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  52.16 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  49.61 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  52.29 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  52.29 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  52.29 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  51.37 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  48.63 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  51.94 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  47.66 
 
 		 244 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  47.06 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  48.03 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  47.45 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  48.43 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.2 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  45.14 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.72 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  44.79 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  45 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  41.41 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  40.93 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  40.23 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  40.15 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  39.77 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  37.74 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  37.98 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  38.22 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  39.62 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  38.28 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  39.15 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  36.33 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.91 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.1 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.3 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.35 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.8 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.15 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.08 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.59 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.83 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  26.56 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.93 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.28 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.1 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.21 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.6 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.6 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.43 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.94 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.47 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.44 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.14 
 
 		 500 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.6 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.64 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.04 
 
 		 507 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.89 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.65 
 
 		 478 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.06 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.06 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.88 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.52 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.13 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.49 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.43 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.88 
 
 		 513 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  24.22 
 
 		 468 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.85 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.94 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.18 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1227  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  25.31 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000574756  normal  0.766781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.41 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.53 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.06 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.44 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0704  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.59 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  28.46 
 
 		 607 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.01 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.06 
 
 		 478 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.02 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4617  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.32 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.449076 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  23.23 
 
 		 492 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  22.83 
 
 		 492 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.92 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.59 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>