117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4424 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  99.21 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  57.59 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  54.05 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  53.12 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  52.14 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.29 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  57.42 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  57.03 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  56.37 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  52.57 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  50.19 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  51.17 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  53.52 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  52.19 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  50.59 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  51.78 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  49.81 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  52.55 
 
 		 244 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  48.83 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  50.6 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  46.88 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  51.71 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  51.76 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  49.04 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  41.63 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  45.59 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  48.83 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  47.47 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  46.62 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  45.56 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  44.09 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  46.67 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  42.59 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.91 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  45.82 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.51 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.91 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.35 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.41 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.86 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.73 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  24.08 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.31 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  35.23 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.11 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.52 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.06 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.63 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.77 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.6 
 
 		 500 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.29 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  31.52 
 
 		 607 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.31 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.96 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.41 
 
 		 516 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0248  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.91 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.64 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.46 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3477  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.39 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.57 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.94 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  21.43 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.23 
 
 		 490 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.84 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  28.07 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  20.59 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0995  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  29.22 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  27.33 
 
 		 511 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.87 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  33.13 
 
 		 558 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.57 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.32 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.01 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.81 
 
 		 495 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.92 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.7 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.92 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.61 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1723  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  24.71 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.26 
 
 		 467 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  24.52 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.61 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0632  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.94 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.4 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.99 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2152  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.29 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.44 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>