60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2879 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  64.08 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  67.89 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  62.35 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 		 262 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  47.39 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.12 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  44.49 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  44.09 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  44.09 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  42.45 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  45.78 
 
 		 297 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  44.62 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  38 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  40.87 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  40.24 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  41.3 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  39.68 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  41.39 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  40.89 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  40.08 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  38.4 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  40.89 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  38.21 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  38.21 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  40.82 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  40.16 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  37.74 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  39.34 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  41.06 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  36.29 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  39.08 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  37.55 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  39.08 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  34.11 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  39.58 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  35.9 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1572  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.72 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1590  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.72 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.388218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.03 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1645  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.34 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839045  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.93 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.93 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1192  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.66 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0836971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1672  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.66 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.07 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.14 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.68 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.67 
 
 		 251 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.77 
 
 		 236 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.57 
 
 		 239 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>