242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2970 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.92 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  53.31 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  52.38 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 261 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  51.98 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  50.98 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  47.62 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  52.17 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  48.03 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  48.83 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  48.83 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  48.44 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  49.4 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  47.24 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  45.02 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  48.43 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  47.64 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  47.2 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  45.42 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.97 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.36 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  44.62 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  45.91 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  46.4 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  40.78 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  41.8 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  40.64 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  42.58 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  42.19 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  40.24 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  38.04 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  39.53 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  40.55 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  40.39 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  37.89 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.84 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.42 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.67 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.31 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.72 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.12 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.27 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.72 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.05 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.75 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.2 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2246  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.67 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2146  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.67 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.67 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.371057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.64 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  28.76 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.66 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2200  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.67 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2193  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.67 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.610513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.95 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.74 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1887  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.17 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.96 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.63 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.68 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0803  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.13 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.427355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.65 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.59 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.8 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.17 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.64 
 
 		 478 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.12 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4617  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.23 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.449076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.78 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  27.51 
 
 		 509 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.88 
 
 		 513 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  25.35 
 
 		 558 aa  52  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.78 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4827  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.03 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.532538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.3 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.08 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.74 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.65 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.62 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.55 
 
 		 495 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  26.64 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4415  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.68 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.44 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.23 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.23 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3652  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.73 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.23 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>