134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0320 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 262 aa  520  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  57.69 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  51.75 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  50.39 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  49.03 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  49.42 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  48.64 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  47.27 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  46.3 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  45.95 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  49.04 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  49.04 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  48.66 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  44.79 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  43.19 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  49.62 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  49.43 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  45.91 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  46.72 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  45.67 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  46.48 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  48.06 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.53 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  48.44 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.06 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  49.42 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  46.88 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  40.54 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  42.52 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  46.92 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  48.06 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  41.63 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  41.86 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  41.8 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.72 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  40.39 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  41.89 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  39.29 
 
 		 246 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  41.54 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  41.54 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  39.76 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.31 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.93 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.44 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.03 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.49 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.37 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  26.44 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.27 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.97 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.54 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.18 
 
 		 458 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.13 
 
 		 451 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.37 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.22 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.41 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.05 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2246  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.17 
 
 		 500 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.13 
 
 		 462 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.36 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.68 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2200  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2146  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.371057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  24.61 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4161  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.17 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0393097  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.88 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.18 
 
 		 467 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.12 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.56 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.13 
 
 		 462 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2193  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.88 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.610513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.25 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1227  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  25.26 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000574756  normal  0.766781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.18 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.87 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0933  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.49 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.65 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  24.12 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.71 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.63 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.89 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.18 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  26.64 
 
 		 607 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.26 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.04 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  23.08 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.01 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.87 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.05 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.39 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.89 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>