More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1505 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.65 
 
 
262 aa  329  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  61.11 
 
 
256 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3091  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.9 
 
 
263 aa  287  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000546581  normal  0.020085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5405  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6616  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
258 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2059  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.13 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2619  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.96 
 
 
257 aa  268  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923758  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.2 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
249 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
246 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
242 aa  196  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  46.25 
 
 
520 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
506 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
271 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.73 
 
 
502 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.9 
 
 
519 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  43.21 
 
 
516 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
258 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
505 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 
463 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 
463 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
276 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.2 
 
 
504 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
464 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
248 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
273 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
239 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  42.46 
 
 
459 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.73 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.05 
 
 
511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.77 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.67 
 
 
504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
511 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.27 
 
 
464 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
250 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.22 
 
 
245 aa  183  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
239 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 
463 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
510 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.21 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.2 
 
 
493 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.74 
 
 
258 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.22 
 
 
258 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.53 
 
 
258 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
464 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
464 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
277 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.42 
 
 
482 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.03 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  44.03 
 
 
513 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.28 
 
 
283 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.5 
 
 
278 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  40.66 
 
 
465 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  42.06 
 
 
459 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
239 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  42.45 
 
 
464 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.35 
 
 
277 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
262 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.85 
 
 
276 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.11 
 
 
512 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.34 
 
 
277 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  41.91 
 
 
474 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.66 
 
 
462 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
281 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
281 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
278 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.25 
 
 
465 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
239 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.8 
 
 
487 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
507 aa  178  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
513 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  41.06 
 
 
457 aa  178  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.8 
 
 
528 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.25 
 
 
482 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.74 
 
 
512 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.51 
 
 
479 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
245 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
264 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.87 
 
 
502 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.25 
 
 
288 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.45 
 
 
258 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
255 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2433  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.32 
 
 
265 aa  175  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.25 
 
 
493 aa  175  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>