More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2433 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2433  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.99 
 
 
273 aa  221  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.5 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.4 
 
 
276 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.44 
 
 
273 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.4 
 
 
276 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 
276 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.6 
 
 
281 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.4 
 
 
276 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.6 
 
 
278 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.6 
 
 
281 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.62 
 
 
277 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.25 
 
 
480 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
269 aa  215  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.25 
 
 
480 aa  214  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  48.58 
 
 
513 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.76 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.76 
 
 
510 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
273 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
472 aa  211  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
464 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 
464 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  49.79 
 
 
462 aa  210  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
463 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
463 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  44.4 
 
 
516 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  48.55 
 
 
520 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
463 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.4 
 
 
269 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.52 
 
 
261 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  45.17 
 
 
464 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  46.75 
 
 
465 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.94 
 
 
519 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.79 
 
 
464 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  46.75 
 
 
465 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  46.67 
 
 
515 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  50 
 
 
513 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
293 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.95 
 
 
489 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
258 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
478 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.47 
 
 
462 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
478 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.63 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.08 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.97 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
258 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
258 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.33 
 
 
513 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  52.1 
 
 
472 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.1 
 
 
472 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  45.8 
 
 
485 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
252 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.72 
 
 
262 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
258 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
258 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
258 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
245 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
258 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
479 aa  198  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.78 
 
 
484 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  44.94 
 
 
457 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
482 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  51.68 
 
 
472 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  47.08 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  46.31 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  43.08 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.46 
 
 
464 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.79 
 
 
480 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.25 
 
 
282 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  44.53 
 
 
459 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  44.53 
 
 
457 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  44.53 
 
 
457 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  44.53 
 
 
457 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.17 
 
 
479 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 
503 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.32 
 
 
246 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.46 
 
 
458 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
475 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.96 
 
 
262 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  45.9 
 
 
478 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  46.25 
 
 
459 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
250 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.11 
 
 
491 aa  192  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
505 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.13 
 
 
457 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
512 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
260 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  44.13 
 
 
457 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>