More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2892 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  80.23 
 
 		 273 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.08 
 
 		 281 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.08 
 
 		 281 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.08 
 
 		 278 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  81.64 
 
 		 276 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  80.69 
 
 		 278 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.69 
 
 		 273 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  81.25 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  81.25 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.03 
 
 		 269 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  80.47 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.54 
 
 		 277 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  80.47 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.3 
 
 		 273 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.56 
 
 		 271 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.02 
 
 		 480 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.97 
 
 		 472 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.02 
 
 		 480 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  55.87 
 
 		 462 aa  272  4.0000000000000004e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  58.68 
 
 		 472 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.68 
 
 		 472 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  58.68 
 
 		 472 aa  265  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.88 
 
 		 464 aa  264  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  53.88 
 
 		 464 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  59.84 
 
 		 472 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  57.03 
 
 		 467 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.47 
 
 		 463 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.47 
 
 		 463 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.25 
 
 		 464 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.2 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  53.08 
 
 		 464 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  54.29 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  52.87 
 
 		 489 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  55.79 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.79 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  55.79 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  55.79 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  55.79 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  56.61 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  55.79 
 
 		 457 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.66 
 
 		 463 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  55.79 
 
 		 457 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  55.79 
 
 		 457 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  55.79 
 
 		 457 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.42 
 
 		 481 aa  258  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  53.85 
 
 		 465 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  55.14 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  55.14 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  54.88 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2138  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.92 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.85 
 
 		 464 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  55.14 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  57.85 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  53.85 
 
 		 465 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  51.6 
 
 		 493 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.09 
 
 		 479 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  55.97 
 
 		 459 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  55.97 
 
 		 457 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  55.97 
 
 		 457 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  55.97 
 
 		 457 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.65 
 
 		 479 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.83 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  56.2 
 
 		 457 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.44 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  55.46 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.24 
 
 		 502 aa  249  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.72 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.28 
 
 		 476 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  54.62 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.38 
 
 		 473 aa  245  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.2 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  49.18 
 
 		 468 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 		 511 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.18 
 
 		 482 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.09 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.87 
 
 		 482 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.6 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.65 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.42 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.22 
 
 		 519 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 		 487 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.04 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.19 
 
 		 510 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  53.31 
 
 		 459 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  53.09 
 
 		 459 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.09 
 
 		 462 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.51 
 
 		 292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  47.54 
 
 		 458 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.65 
 
 		 507 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.91 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.79 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 		 503 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.67 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.26 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  49.8 
 
 		 476 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.02 
 
 		 261 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>