More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0492 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.39 
 
 
512 aa  256  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.26 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
479 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.74 
 
 
502 aa  249  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  47.74 
 
 
505 aa  248  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
519 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  48.56 
 
 
513 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  45.9 
 
 
513 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  47.03 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.95 
 
 
464 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  46.72 
 
 
465 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  46.31 
 
 
465 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.56 
 
 
258 aa  240  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
262 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50 
 
 
250 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  44.08 
 
 
516 aa  240  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.97 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.56 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.56 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.33 
 
 
479 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.56 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.56 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
252 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  47.13 
 
 
464 aa  238  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
464 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  47.13 
 
 
464 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18271  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
261 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  45.27 
 
 
520 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.5 
 
 
462 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.71 
 
 
282 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
267 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
261 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.54 
 
 
283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.74 
 
 
273 aa  234  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
245 aa  234  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  44.44 
 
 
468 aa  234  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
504 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
504 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.82 
 
 
462 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.98 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
463 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
505 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
512 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.54 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
250 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.67 
 
 
493 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
463 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 
511 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
464 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
503 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
463 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.49 
 
 
489 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
281 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
278 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29821  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
261 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.564454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.39 
 
 
288 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
281 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
293 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
278 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.97 
 
 
258 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
276 aa  229  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.12 
 
 
266 aa  229  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
276 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.03 
 
 
458 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
272 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
276 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
277 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
269 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
258 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
258 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.21 
 
 
297 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
273 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.56 
 
 
482 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
507 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
503 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
269 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
271 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.15 
 
 
275 aa  225  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
276 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
510 aa  224  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
292 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  44.03 
 
 
473 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  47.33 
 
 
259 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
265 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.74 
 
 
484 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  44.03 
 
 
473 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
503 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  44.03 
 
 
470 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>