More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41563 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  96.73 
 
 
245 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.21 
 
 
247 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.88 
 
 
245 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.97 
 
 
246 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.25 
 
 
246 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.72 
 
 
253 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.72 
 
 
253 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.68 
 
 
246 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.57 
 
 
250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.68 
 
 
246 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.2 
 
 
277 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.05 
 
 
259 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
261 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.08 
 
 
274 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.23 
 
 
285 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.58 
 
 
270 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.67 
 
 
274 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.42 
 
 
308 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 
249 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
288 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.45 
 
 
269 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.45 
 
 
269 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 
339 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.48 
 
 
294 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.48 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.35 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.14 
 
 
273 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.36 
 
 
272 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 
262 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.29 
 
 
273 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.62 
 
 
261 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.75 
 
 
262 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.04 
 
 
247 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.93 
 
 
278 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.52 
 
 
286 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
275 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.5 
 
 
278 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.04 
 
 
249 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.5 
 
 
281 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.5 
 
 
281 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
283 aa  201  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.07 
 
 
277 aa  201  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.9 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.21 
 
 
276 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.64 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.58 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.83 
 
 
258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.75 
 
 
266 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
258 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.21 
 
 
276 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  48.72 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.83 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.78 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.58 
 
 
463 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.23 
 
 
491 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
276 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.58 
 
 
463 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
464 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.29 
 
 
464 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.83 
 
 
473 aa  194  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
463 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.71 
 
 
284 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
271 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2433  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.63 
 
 
265 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
272 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
246 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.81 
 
 
464 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
503 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.4 
 
 
271 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  49.57 
 
 
401 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
503 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
277 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  48.72 
 
 
476 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.72 
 
 
478 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.37 
 
 
267 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.35 
 
 
507 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
288 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.78 
 
 
264 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1324  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
309 aa  191  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  0.902463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>