More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2492 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
272 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.6 
 
 
276 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.01 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.48 
 
 
277 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  68.88 
 
 
271 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.3 
 
 
464 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  58.37 
 
 
462 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  57.14 
 
 
465 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.02 
 
 
463 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.02 
 
 
463 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.6 
 
 
463 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.15 
 
 
464 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.17 
 
 
464 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  56.3 
 
 
465 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  56.6 
 
 
464 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.15 
 
 
481 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  52.61 
 
 
458 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  60.09 
 
 
470 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  60.09 
 
 
473 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  60.09 
 
 
473 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  55.74 
 
 
464 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  55.74 
 
 
489 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.69 
 
 
283 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.54 
 
 
502 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.6 
 
 
482 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  55.46 
 
 
493 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.02 
 
 
482 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.82 
 
 
479 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.78 
 
 
470 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.26 
 
 
479 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  58.37 
 
 
467 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  57.94 
 
 
457 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  57.94 
 
 
457 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  53.64 
 
 
279 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  57.94 
 
 
457 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.08 
 
 
472 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  56.22 
 
 
459 aa  255  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  56.41 
 
 
474 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.8 
 
 
480 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  54.89 
 
 
459 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.59 
 
 
292 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  55.74 
 
 
457 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2138  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.33 
 
 
299 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  55.79 
 
 
459 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  55.33 
 
 
295 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  55.79 
 
 
457 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  55.79 
 
 
457 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  55.79 
 
 
457 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  54.51 
 
 
468 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  56.6 
 
 
279 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  55.79 
 
 
457 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.94 
 
 
480 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.97 
 
 
296 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.67 
 
 
286 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.13 
 
 
254 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.04 
 
 
462 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.65 
 
 
290 aa  244  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  52.16 
 
 
275 aa  241  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
473 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.25 
 
 
528 aa  240  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.01 
 
 
297 aa  240  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.19 
 
 
262 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1262  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.17 
 
 
284 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.2 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.92 
 
 
473 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.21 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.73 
 
 
259 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.65 
 
 
263 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.65 
 
 
282 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
277 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  53.16 
 
 
462 aa  237  2e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  56.6 
 
 
472 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  56.6 
 
 
472 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.6 
 
 
472 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  50.4 
 
 
554 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.15 
 
 
487 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.77 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  53.72 
 
 
401 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
258 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 
281 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 
281 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
273 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
258 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 
278 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 
497 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
276 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.51 
 
 
493 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
258 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
258 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
258 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
258 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>