More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1402 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
261 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.95 
 
 
288 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  79.12 
 
 
274 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.37 
 
 
269 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.21 
 
 
274 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  71.76 
 
 
269 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.62 
 
 
270 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.54 
 
 
268 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69 
 
 
308 aa  348  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  79.39 
 
 
286 aa  337  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  65 
 
 
259 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.05 
 
 
277 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.93 
 
 
339 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.87 
 
 
247 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.4 
 
 
254 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.1 
 
 
250 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.11 
 
 
245 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
245 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.94 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.11 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.52 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.24 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.52 
 
 
246 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.24 
 
 
269 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
294 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.48 
 
 
253 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.05 
 
 
253 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
294 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
249 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.98 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.36 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.95 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
254 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
272 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.68 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.16 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.58 
 
 
277 aa  211  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.11 
 
 
283 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.15 
 
 
277 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.12 
 
 
249 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  44.49 
 
 
468 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  48.73 
 
 
474 aa  208  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 
273 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
267 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
267 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
276 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
262 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.02 
 
 
340 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.02 
 
 
340 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.02 
 
 
274 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  48.03 
 
 
467 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.36 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.36 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.36 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.26 
 
 
291 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.36 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.76 
 
 
271 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  47.5 
 
 
459 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.46 
 
 
464 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.75 
 
 
493 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.88 
 
 
272 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
288 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
264 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
259 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
502 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.58 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
479 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
273 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
273 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  45.42 
 
 
464 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  46.25 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.73 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18271  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.71 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.73 
 
 
462 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55 
 
 
256 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  47.08 
 
 
473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  45.15 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  46.06 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  47.08 
 
 
473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  47.08 
 
 
470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  44.44 
 
 
465 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
463 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
503 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.04 
 
 
489 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.1 
 
 
503 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  44.4 
 
 
465 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1718  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.16 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  49.58 
 
 
295 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1913  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.16 
 
 
282 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4145  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.25 
 
 
255 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0746757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.05 
 
 
464 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.08 
 
 
293 aa  195  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
273 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>