More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2843 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
269 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  98.88 
 
 
269 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.76 
 
 
270 aa  400  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.5 
 
 
308 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.84 
 
 
288 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  82.04 
 
 
286 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.24 
 
 
268 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  76.54 
 
 
274 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.76 
 
 
261 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.07 
 
 
274 aa  360  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  65.97 
 
 
259 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.26 
 
 
277 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.45 
 
 
250 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.99 
 
 
247 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.45 
 
 
253 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.45 
 
 
245 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.84 
 
 
269 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.04 
 
 
245 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.59 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.45 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.43 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.04 
 
 
246 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
246 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.59 
 
 
339 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.61 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.02 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
464 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
246 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.93 
 
 
246 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.86 
 
 
247 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.72 
 
 
249 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
272 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  48.74 
 
 
474 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
285 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
503 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.77 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.61 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  45.45 
 
 
464 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.61 
 
 
277 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45 
 
 
267 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.11 
 
 
276 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.66 
 
 
464 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
340 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
267 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.4 
 
 
462 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.15 
 
 
482 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.12 
 
 
458 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
503 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  44.58 
 
 
465 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.82 
 
 
284 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
481 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
273 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  44.18 
 
 
465 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
283 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
463 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.17 
 
 
463 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.98 
 
 
464 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.33 
 
 
493 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  48.12 
 
 
457 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.86 
 
 
258 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
479 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  48.13 
 
 
467 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.46 
 
 
273 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.46 
 
 
273 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.17 
 
 
463 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.44 
 
 
490 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.91 
 
 
464 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
291 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  47.88 
 
 
401 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
478 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.37 
 
 
271 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  47.11 
 
 
459 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.17 
 
 
253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  47.11 
 
 
457 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.4 
 
 
271 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  47.11 
 
 
457 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.02 
 
 
489 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
264 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  47.11 
 
 
457 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.17 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>