More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1628 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.48 
 
 
294 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  97.77 
 
 
269 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  97.99 
 
 
249 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  80.76 
 
 
339 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  92.37 
 
 
249 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  91.16 
 
 
249 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.57 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.31 
 
 
247 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.34 
 
 
264 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.23 
 
 
268 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.46 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.69 
 
 
274 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
261 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.02 
 
 
270 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.43 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.43 
 
 
269 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.03 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.48 
 
 
245 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
259 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.38 
 
 
245 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.46 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.77 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.52 
 
 
246 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
253 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
247 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.08 
 
 
246 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.89 
 
 
255 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
245 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.72 
 
 
246 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
253 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.08 
 
 
266 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
285 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.91 
 
 
250 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.26 
 
 
267 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 
267 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
262 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.52 
 
 
482 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.94 
 
 
273 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.94 
 
 
273 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.22 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.88 
 
 
254 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
263 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  47.01 
 
 
457 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
265 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  47.01 
 
 
457 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.17 
 
 
259 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  47.01 
 
 
457 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.42 
 
 
288 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
481 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
272 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
258 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
276 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
264 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
479 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
502 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
513 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45 
 
 
276 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
258 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
261 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  46.58 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
258 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  46.58 
 
 
457 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  46.58 
 
 
457 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
258 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  46.58 
 
 
457 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
272 aa  188  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.5 
 
 
478 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.1 
 
 
286 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.88 
 
 
510 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
258 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
258 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
258 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.61 
 
 
278 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
258 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
507 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
276 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.14 
 
 
283 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  46.58 
 
 
457 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
293 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  47.7 
 
 
474 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  44.4 
 
 
473 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  48.5 
 
 
476 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.26 
 
 
502 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  46.58 
 
 
457 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
258 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  39.41 
 
 
492 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45 
 
 
276 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2225  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.41 
 
 
279 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00956317  normal  0.224221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>