More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2725 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  46.86 
 
 
513 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
252 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
263 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.78 
 
 
277 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.26 
 
 
277 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.7 
 
 
278 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1746  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
279 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
245 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.85 
 
 
245 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.54 
 
 
476 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.98 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
478 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
276 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
276 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.86 
 
 
481 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
264 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.15 
 
 
259 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.98 
 
 
272 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.17 
 
 
273 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
249 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  40.73 
 
 
513 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
246 aa  208  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.51 
 
 
264 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
339 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.55 
 
 
269 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
478 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
262 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
473 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
487 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.21 
 
 
464 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
267 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.82 
 
 
478 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.9 
 
 
464 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.03 
 
 
264 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.08 
 
 
271 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.53 
 
 
525 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.71 
 
 
269 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.67 
 
 
258 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.67 
 
 
258 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44 
 
 
267 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.6 
 
 
267 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
480 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
504 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  43.51 
 
 
515 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
246 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
513 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
261 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.55 
 
 
246 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.26 
 
 
294 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
463 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
260 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
250 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.15 
 
 
458 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2225  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
279 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00956317  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
528 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
249 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2624  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.13 
 
 
280 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0021256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.15 
 
 
268 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  42.8 
 
 
520 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
476 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
463 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2366  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
279 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
261 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
491 aa  201  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1297  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.08 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
504 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.75 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.98 
 
 
502 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1888  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.08 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.17 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  44.26 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.25 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05583  siroheme synthase  41.6 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.5 
 
 
464 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.32 
 
 
503 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.17 
 
 
464 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.3 
 
 
478 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  46.03 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1260  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.08 
 
 
282 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.33 
 
 
554 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
479 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.57 
 
 
512 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.931539  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  43.57 
 
 
465 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.17 
 
 
462 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  43.57 
 
 
465 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>