More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1746 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1746  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
279 aa  556  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.48 
 
 
279 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.931539  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2624  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.19 
 
 
280 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0021256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1297  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.81 
 
 
282 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2366  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.58 
 
 
279 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1888  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.81 
 
 
293 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1260  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.44 
 
 
282 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1055  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.55 
 
 
301 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43178  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1692  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  68.87 
 
 
281 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127844  normal  0.0407168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3362  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.36 
 
 
291 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2225  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.15 
 
 
279 aa  249  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00956317  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5731  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.87 
 
 
267 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.07 
 
 
513 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  47.56 
 
 
513 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
510 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
511 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
503 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.14 
 
 
493 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
252 aa  218  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  45.93 
 
 
505 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  50.83 
 
 
515 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.56 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
507 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  48.56 
 
 
474 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
479 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
503 aa  214  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  46.72 
 
 
513 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.53 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.98 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
276 aa  211  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  46.72 
 
 
520 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.83 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.29 
 
 
473 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
278 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
276 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.99 
 
 
502 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
276 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
258 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.94 
 
 
256 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  44.66 
 
 
464 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.06 
 
 
489 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.36 
 
 
464 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
281 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
281 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
278 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05583  siroheme synthase  47.11 
 
 
301 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001603  uroporphyrinogen-III methyltransferase  47.93 
 
 
301 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.66 
 
 
464 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.27 
 
 
277 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
510 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
277 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
463 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.94 
 
 
519 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  45.82 
 
 
465 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.75 
 
 
258 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46 
 
 
472 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
463 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.63 
 
 
458 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.54 
 
 
269 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.58 
 
 
463 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
297 aa  205  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
464 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
480 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  43.85 
 
 
259 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
511 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
479 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  45.42 
 
 
465 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.55 
 
 
512 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 
497 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.62 
 
 
507 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
269 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.19 
 
 
283 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.15 
 
 
273 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.62 
 
 
503 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.34 
 
 
525 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  45.08 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  45.08 
 
 
459 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.39 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  45.08 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
480 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  45.08 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  43.63 
 
 
467 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.37 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.8 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.67 
 
 
579 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  45.08 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  43.9 
 
 
468 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  43.2 
 
 
462 aa  199  3e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
481 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44 
 
 
464 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.39 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
504 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>