More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001603 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001603  uroporphyrinogen-III methyltransferase  100 
 
 
301 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05583  siroheme synthase  92.36 
 
 
301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  50.19 
 
 
457 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.22 
 
 
293 aa  235  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  51.82 
 
 
457 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  51.82 
 
 
457 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  51.82 
 
 
459 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  51.82 
 
 
457 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  51.82 
 
 
457 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.62 
 
 
473 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  50.21 
 
 
457 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1506  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.35 
 
 
294 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  50.21 
 
 
457 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  50.21 
 
 
457 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1872  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
286 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0354074  hitchhiker  0.00000022956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1808  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.92 
 
 
324 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2768  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.76 
 
 
286 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00920266  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.94 
 
 
288 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.67 
 
 
458 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.08 
 
 
464 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  50.21 
 
 
464 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  51.05 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.57 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  50.21 
 
 
464 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.92 
 
 
463 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.85 
 
 
482 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
463 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
463 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
464 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  50.21 
 
 
465 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  50.42 
 
 
467 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.92 
 
 
464 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.92 
 
 
480 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000072  uroporphyrinogen-III methyltransferase  54.81 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  47.13 
 
 
459 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  47.92 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.56 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.25 
 
 
489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  48.95 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  49.58 
 
 
462 aa  209  3e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.6 
 
 
283 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
480 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  47.72 
 
 
459 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.59 
 
 
262 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  49.58 
 
 
279 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1746  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.93 
 
 
279 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
482 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  48.12 
 
 
473 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  49.58 
 
 
279 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.85 
 
 
277 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  48.12 
 
 
473 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  49.04 
 
 
472 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  48.12 
 
 
470 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
273 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  47.43 
 
 
474 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.84 
 
 
263 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.79 
 
 
314 aa  205  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190604  normal  0.797917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
272 aa  205  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
276 aa  205  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.02 
 
 
502 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 
249 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.14 
 
 
480 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.5 
 
 
273 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.21 
 
 
290 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
505 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
278 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.7 
 
 
493 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1324  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
309 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.25 
 
 
258 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
276 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
271 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
258 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1262  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.96 
 
 
284 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
276 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
504 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.83 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  44.76 
 
 
259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.51 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.87 
 
 
504 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
512 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1055  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43178  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.13 
 
 
487 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>